ในขณะที่ “สงครามเหนือเวหา” กลุ่มนักบินรบที่ยังเด็กอยู่เสมอ ต่อสู้กับศัตรูในอุตลุดอันน่าทึ่งเหนือเมฆ พวกเขาก็สูญเสียความบริสุทธิ์ไปในทันที

ในไทม์ไลน์ประวัติศาสตร์ทางเลือกของ “The Sky Crawlers” บริษัทเอกชนจ้างนักบินรบเพื่อต่อสู้กันในการต่อสู้จริงเพื่อสงบสติอารมณ์ประชากรที่เคยก่อสงครามและการรุกรานในขณะที่โลกสงบสุข ภาพยนตร์เรื่องนี้แนะนำตัวละครที่เรียกว่ามนุษย์ Kildren
ฮิวแมนนอยด์เหล่านี้มีการเปลี่ยนแปลงยีนที่ทำให้สามารถมีชีวิตอยู่ได้ตลอดไปในช่วงวัยรุ่น หลังจากการเสียชีวิตของนักบินสามคนจาก Rostock Corporation นักบินขับไล่ Yichi Kannami ก็ถูกย้ายไปที่ Area 262 หลังจากได้พบกับหัวหน้าช่าง Towa Sasakura
เขาก็สอบถามเกี่ยวกับชะตากรรมของนักบินคนก่อนของเครื่องบินลำนี้ Kannami ได้พบกับ Suito Kusanagi ผู้บัญชาการฐานทัพ เขาไม่ได้บอกว่าเกิดอะไรขึ้นกับนักบินคนก่อน แต่เขาเรียกเขาว่าคุริตะ จินโรห์ หลังจากนั้นเขาได้พบกับนักบินฐานที่เหลือ: Aizu
Yudagawa, Yuriyuki Shinota และ Naofumi Tokino